Contrats et projets en lien avec le groupe

Sont présentés ici par ordre antichronologique et de manière certainement non exhaustive les projets d'envergure nationale et internationale des différents acteurs du groupe Bioss.

Projets nationaux

  • ANR-FNR AlgoReCell 2016 - 36 mois (programme générique)
    Titre: Computational Models and Algorithms for the Prediction of Cell Reprogramming Determinants with High Efficiency and High Fidelity
    Partenaires : LRI (Univ. Paris-Sud / CNRS); LSV/Inria Saclay; Institut Curie; FSTC Life (Univ. Luxembourg); FSTC CSC (Univ. Luxembourg); Luxembourg Centre for Systems Biomedicine (Univ. Luxembourg)
    http://algorecell.lri.fr
  • ANR CenTuri 2016 - 120 mois (programme IA Instituts Convergences)
    Titre : Centre Turing des systèmes vivants
    Partenaires: IBDM, CIML, INMED, I2M, CPT, CINAM, Fresnel, IRPHé, IUSTI, LIF (Univ. Aix-Marseille / CNRS), LAI (Univ. Aix-Marseille / APHM / INSERM), Bio-AFM, TAGC (Univ. Aix-Marseille / INSERM), M2P2 (École centrale Marseille / Univ. Aix-Marseille / CNRS) et CIPHE (Univ. Aix-Marseille / INSERM / CNRS)
  • ANR MEMIP 2016 - 48 mois (programme générique)
    Titre : Modèles à effets mixtes de processus intracellulaires : méthodes, outils et applications
    Partenaires : Lifeware (Inria Saclay), MSC (Univ. Paris Diderot / CNRS), IBIS (Inria Grenoble / Univ. Grenoble) et XPOP (Inria Saclay / École Polytechnique)
  • ANR ICycle 2016 -- ?? mois (programme générique)
    Titre : Interconnexion et contrôle de deux oscillateurs biologiques dans des cellules mammaliennes
    Partenaires : Biocore (INRIA Sophia), iBV (Univ. Nice - Sophia / CNRS) et Maiage-Biosys (INRA Jouy-en-Josas)
  • ANR HYCLOCK 2015 - 48 mois (programme "Une nouvelle représentation du vivant")
    Titre : Modélisation hybride formelle du temps pour la biologie des horloges circadiennes et la chronopharmacologie
    Partenaires : iBV, I3S (Nice), INSERM UMR-S776 (Orsay), IRCCyN (Nantes), Lifeware (INRIA Rocquencourt)
  • ANR SAMOSA 2014 - 48 mois (programme BIOADAPT)
    Titre : Synechococcus as a model genus for studying adaptation of marine phytoplankton to environmental changes
    Partenaires : ABIMS (Station Roscoff), LINA (Univ. Nantes), AD2M (Univ. européenne Bretagne)
  • ANR STOCH-MC 2014 - 48 mois (programme blanc SIMI 2)
    Titre :
    Partenaires : IRISA (INRIA Rennes), Lifeware (INRIA Rocquencourt), LIAFA (Univ. Paris 7), LaBRI (Univ. Bordeaux)
  • ANR CADMIDIA 2013 - 48 mois (programme CESA)
    Titre : Cadmium et diabète
    Partenaires : TIMC-IMAG (Univ. Grenoble), VERIMAG (Univ. Grenoble), CBM (CEA Grenoble), LBFA (INSERM Grenoble)
  • ANR Iceberg 2012 - 60 mois (programme IA Bio-informatique)
    Titre : Des modèles de population aux populations de modèles: observation, modélisation et contrôle de l’expression génique au niveau de la cellule unique
    Partenaires : Lifeware (INRIA Rocquencourt), LIFL (Univ. Lille), PPS & IJM & MSC (Univ. Paris 7), CGMC (Univ. Lyon)
  • ANR RESET 2012 - 48 mois (programme IA Bio-informatique)
    Titre : Eteindre et rallumer la machinerie d'expression génique chez les bactéries: de modèles mathématiques aux applications biotechnologiques
    Partenaires : IBIS (INRIA Grenoble), LAPM (Univ. Grenoble), LIPhy (Univ. Grenoble), BGE (CEA Grenoble), Génétique végétale (INRA), BIOCORE (INRIA Sophia), Metabolic Explorer
  • ANR Facteur 4 2012 - 36 mois (programme Bio-ME)
    Titre : Amélioration non OGM des performances de microalgues
    Partenaires : BIOCORE (INRIA Sophia), OOV (Univ. Paris 6), PBA (IFREMER)
  • ANR FatInteger 2012 - 36 mois (programme blanc SVSE 7)
    Titre : Recherche de régulateurs clefs de la plasticité lipidique chez deux espèces monogastriques majeures (porc et poule) en combinant des données haut débit et des approches statistique, bioinformatique et phylogénique
    Partenaires : IRISA (CNRS Bretagne), GARen & SENAH & URA (INRA), LMA-IRMAR (AGROCAMPUS Ouest)
  • ANR MiRNAdapt 2012 - 36 mois (programme blanc SVSE 6)
    Titre : MicroARN et plasticité phénotypique
    Partenaires : IRISA (CNRS Bretagne), IGH (CNRS Languedoc), BiO3P (INRA)
  • ANR IDEALG 2011 - 96 mois (programme IA Santé-Biotechnologies)
    Titre : Étude génomique et post-génomique des algues pour le développement de nouveaux outils et méthodes permettant d’identifier et sélectionner des populations « ressource » locales ayant un intérêt industriel
    Partenaires : LBI2M (Univ. Paris 6), IRISA (CNRS Bretagne), UFIP (Univ. Nantes), CEVA, COS (ÉNSC Rennes), ALEOR, LBCM (Univ. Bretagne sud), C-WEED, IFREMER Brest, BEZHIN ROSKO, FRANCE HALIOTIS, AGROCAMPUS Ouest, AMURE (Univ Bretagne occidentale), LBE (INRA), DuPont
  • ANR STOCHAGENE 2011 - 48 mois (programme blanc SVSE 6)
    Titre : Rôle de la dynamique chromatinienne dans la stochasticité de l’expression génique dans des cellules d’eucaryotes supérieurs
    Partenaires : CGPMC (Univ. Lyon), LIRIS (INSA-Lyon), U951 (INSERM Paris XII)
  • ANR BioTempo 2011 - 42 mois (programme Blanc SIMI 2)
    Titre : Langages, concepts de temps et modèles hybrides pour l'analyse de modèles incomplets en biologie moléculaire
    Partenaires : IRISA (CNRS Bretagne), I3S (CNRS Côte d'azur), LINA (Univ. Nantes), IRCCyN (É.C. Nantes), Lifeware (INRIA Rocquencourt), DIMNP (Univ. Montpellier), LBI2M (Univ. Paris 6), SeRAIC (Univ. Rennes), Mathomics (Univ. Santiago), Institut für Informatik (Univ. Postdam), Institut du thorax (Univ. Nantes)
  • ANR SYNBIOTIC 2010 - 48 mois (programme blanc SIMI 3)
    Titre : Systèmes biologiques de synthèse : de la conception à la compilation
    Partenaires : IBISC (Univ. Évry), LACL (Univ. Créteil), CREA ISC-PIF (CNRS IDF Ouest et Nord)
  • ANR GeMCo 2010 - 36 mois (programme blanc SIMI 2)
    Titre : Réduction, validation expérimentale et contrôle de modèles de la machinerie d'expression génique chez E. Coli
    Partenaires : IBIS (INRIA Grenoble), BIOCORE (INRIA Sophia), LAPM (Univ. Grenoble)

Projets internationaux

  • ERC Advanced grant RULE 2013 - 60 mois (programme FP7-IDEAS-ERC)
    Titre : Rule-based modelling
    Partenaires : Univ. Édimbourg
  • EU EvoEvo 2013 - 36 mois (programme FP7-ICT)
    Titre : Evolution of evolution
    Partenaires : BEAGLE (INRIA Grenoble), LAPM (Univ. Grenoble), Univ. Utrecht (Pays-Bas), Univ. York (U.K), CSIC (Spain)
  • ERC Advanced grant SISYPHE 2010 - 60 mois (programme FP7-IDEAS-ERC)
    Titre : Species identity and symbiosis formally and experimentally explored
    Partenaires : BAMBOO (INRIA Grenoble)

Projets régionaux

  • PACA FRI 2015 - 24 mois (programme APEX)
    Titre : Fondements des réseaux d'interactions
    Partenaires : LIF, I2M (Univ. Aix-Marseille), I3S (Univ. Nice-Sophia)